Het kabinet heeft de provincies Flevoland en Noord-Holland opdracht gegeven om het proces te trekken dat leidt tot een Agenda voor de Toekomst van het Markermeer-IJmeer. Voor eind 2007 moet er een voorstel liggen, gericht op ecologie en waterhuishouding en veiligheid tegen overstromen. ARCADIS heeft de provincie Flevoland ondersteund met adviezen over procesmanagement en beleidsanalyse en met uitvoerende werkzaamheden.
De ministeries van V&W, LNV en VROM, de gemeenten Amsterdam, Almere en Lelystad en Natuurmonumenten, Staatsbosbeheer en ANWB zijn ook deelnemer in het project. Het Markermeer-IJmeer is een Natura 2000-gebied, tegelijkertijd zijn er allerlei initiatieven voor ontwikkelingen in het water en langs de randen. Dit maakt het project extra complex.
ARCADIS heeft het startdocument geredigeerd en verzorgde in de opstartfase het programmasecretariaat en voorzitterschap van het ambtelijk overleg tussen de deelnemende partijen. Daarnaast heeft ARCADIS de Bestuurlijke Consultatieronde uitgevoerd waarin zo’n 25 partijen zijn gehoord. Op basis van deze consultatie is een advies uitgebracht over de inrichting van het planproces.
Flevoland wil dat er met visie wordt gewerkt aan een Markermeer dat in 2030 meerwaarde heeft voor ecologie, economie en emotie. Door eerst te waarborgen dat de ecologie wint aan kwaliteit, kan er ook ruimte komen voor andere ontwikkelingen. ARCADIS levert de programmasecretaris die zelfstandig een aantal projecten oppakt en de programmanager ondersteunt door het opstellen van een Plan van Aanpak. Verder organiseert en leidt hij bijeenkomsten, analyseert resultaten en trekt conclusies.